So wie das Gesamtparlament über Ausschüsse verfügt, in denen Gesetzentwürfe und andere politische Vorhaben im Einzelnen erörtert werden, so hat die CSU-Landesgruppe Arbeitskreise für die verschiedenen Politikbereiche gebildet. In ihnen vollzieht sich die politische Detailarbeit, über deren Kurs die Gesamtheit der CSU-Landesgruppe abschließend entscheidet. In den Arbeitskreisen aktiv sind die jeweiligen Mitglieder und stellvertretenden Mitglieder derjenigen Bundestagsausschüsse, deren Aufgabengebiete sich in den Themenfeldern der Arbeitskreise widerspiegeln.
Die Vorsitzenden der Arbeitskreise fungieren als Sprecher der CSU-Landesgruppe für klar umrissene Politikbereiche.
Arbeitskreis I:
Innen und Recht, Kommunalpolitik, Sport und Ehrenamt, Kultur und Medien
Vorsitz: Stephan Mayer
Arbeitskreis II:
Wirtschaft, Technologie, Energie, Verkehr, Bau und Stadtentwicklung, Bildung und Forschung, Tourismus

Vorsitz: Dr. Georg Nüßlein
Arbeitskreis III:
Finanzen und Haushalt

Vorsitz: Bartholomäus Kalb
Arbeitskreis IV:
Arbeit und Soziales, Gesundheit, Familie, Senioren, Frauen und Jugend

Vorsitz: Max Straubinger
Arbeitskreis V:
Auswärtiges, Verteidigung, Angelegenheiten der Europäischen Union, wirtschaftliche Zusammenarbeit und Entwicklung, Menschenrechte und humanitäre Hilfe

Vorsitz: Thomas Silberhorn
Arbeitskreis VI:
Umwelt, Naturschutz und Reaktorsicherheit, Ernährung, Landwirtschaft und Verbraucherschutz

Vorsitz: Dr. Max Lehmer